微生物实验实训室始建于2006年，使用面积120 m²，现有仪器设备总值17.0万元。实验设备主要有生物显微镜15台、霉菌培养箱1台、微电脑生化培养箱1台、恒温培养摇床2台、恒温双人双向任意定位型净化工作台2台、冷冻真空干燥机1台、高压蒸汽灭菌器1台。

本室主要承担食品科学与工程专业和食品质量与安全专业的微生物学课程的实验教学任务，并承担一定的教师科研任务和对外服务。